Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3072747	3073277	531	14 [0]	[0] 67	yggC	conserved hypothetical protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain

TTTTCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAATTTT  >  W3110S.gb/3073278‑3073342 |                                                                 ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATc                               >  1:33078/1‑36 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCa                      >  1:1030651/1‑45 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCa                      >  1:1445146/1‑45 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCAtt                    >  1:1307415/1‑47 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCAtt                    >  1:310773/1‑47 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCa       >  1:204869/1‑60 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:217568/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:499245/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:460962/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:415455/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:240524/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:557953/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1875875/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1860231/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:184452/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1805557/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1772972/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1765859/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:508484/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1757567/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:566565/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:571117/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:573460/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:584197/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:655286/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:669162/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:750412/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:773449/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:804660/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:818776/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:883486/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:910637/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:958624/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1376958/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1020410/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:10514/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1061862/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1073864/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1120055/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:113152/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1170786/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1191359/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1231960/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:12776/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1356219/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:135985/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1373642/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1015591/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1425055/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1505741/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1720933/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1682448/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1672106/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1671249/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1650290/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1635538/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1635365/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1590840/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1544430/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1506403/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:149667/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAttt   >  1:1646733/1‑64 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAttt   >  1:1129982/1‑64 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGGTAATTCAAtt    >  1:735234/1‑63 (MQ=255) ttttCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCCGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:859724/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCTCCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCGATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:1781893/1‑65 (MQ=255) ttttCAATCTCATCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAAtttt  >  1:324522/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TTTTCAATCTCTTCGTTCTGGTACTGTGCCTGTATCTTCAGCCCATTCACCGTTAATTCAATTTT  >  W3110S.gb/3073278‑3073342

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑