Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3111506	3111567	62	64 [0]	[0] 23	yghF	predicted secretion pathway protein, C‑type protein

CCAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGT  >  W3110S.gb/3111568‑3111632 |                                                                 ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1126817/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:931371/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:629537/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:576853/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:565794/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:471939/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:407022/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:282292/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:280229/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:271863/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:209359/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1837930/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:175046/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1731988/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1720350/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1679987/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1558923/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1510720/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1500065/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1284800/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1198989/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGt  <  1:1072041/65‑1 (MQ=255) ccAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGACTGTCTCTGGt  <  1:1756664/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CCAGAACATCCCGCGTGCAATTTTTCGCAGATGCTCTTTGTCTGTATTAAGAGATTGTCTCTGGT  >  W3110S.gb/3111568‑3111632

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑