Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3113906	3113932	27	61 [0]	[0] 36	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

ACCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTTGTG  >  W3110S.gb/3113933‑3113997 |                                                                 aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGtt                    >  1:1346684/1‑47 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:571177/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:392453/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:406523/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:457562/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:463793/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:489885/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:521659/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:524034/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:52743/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:362903/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:577131/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:666016/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:703815/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:792014/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:874602/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:940974/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:981374/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1564500/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1057046/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1136248/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1241873/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1324388/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1384234/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1022640/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1609684/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1626223/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1652479/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1851962/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1862214/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:25073/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:254856/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:319296/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtatg  >  1:1214616/1‑65 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGAGaa              >  1:676999/1‑53 (MQ=255) aCCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCCGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTtgtg  >  1:1170959/1‑65 (MQ=255) |                                                                 ACCGGATAACCCGAATGCGCATCACCGATGGAGATCTGCACATCGTTGGTGAAACGATGTTTGTG  >  W3110S.gb/3113933‑3113997

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑