Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3116529	3116540	12	14 [0]	[0] 87	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

CAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATA  >  W3110S.gb/3116541‑3116603 |                                                               cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCCCCTTCCCCCAGCGTCGCAc           >  1:1399028/1‑54 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGc                  >  1:707949/1‑47 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCg              >  1:787683/1‑51 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCAc           >  1:122269/1‑54 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGtata  >  1:1471641/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGAt   >  1:1506600/1‑62 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGAt   >  1:827095/1‑62 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGAt   >  1:1491923/1‑62 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGAt   >  1:1327139/1‑62 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGAt   >  1:228545/1‑62 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:566208/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:532639/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:52752/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:502192/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:537093/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:541528/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:399358/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:493429/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:483686/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:470180/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:452545/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:446095/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:43254/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:429996/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:411355/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:409842/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:407699/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1079228/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:841388/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:974749/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:967835/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:957034/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:931537/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:906386/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:891940/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:888941/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:861606/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:845541/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:608501/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:799066/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:798843/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:759768/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:756352/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:732070/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:72022/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:69085/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:668850/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1373712/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1552983/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:151339/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1497233/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1475399/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1472663/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1458371/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1455120/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:140542/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1385770/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1611439/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1367749/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1339172/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1336565/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1335553/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1295799/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1272724/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1220315/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1085623/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1076470/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1752532/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:361762/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:346237/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:303980/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1850075/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1809462/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1792810/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1760054/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:376618/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1749207/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1734687/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1722352/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:170777/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1683106/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1681673/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1634288/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1620120/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATa  >  1:1616490/1‑63 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTACCCCCAGCGTCGCACCGTTGGa    >  1:1829741/1‑61 (MQ=255) cAATAAATTCGTTAGGCAGATTAAAGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGAt   >  1:272737/1‑62 (MQ=255) |                                                               CAATAAATTCGTTAGGCAGATTAACGACTTGCTCACCTTCCCCCAGCGTCGCACCGTTGGATA  >  W3110S.gb/3116541‑3116603

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑