Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	271249	271345	97	113 [0]	[0] 93	insO	partial transposase of insertion element IS911A

CGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACC  >  W3110S.gb/271346‑271410 |                                                                 cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATc                         >  1:1508616/1‑42 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCaa                       >  1:466157/1‑43 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGtgtg                  >  1:58876/1‑49 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGAt        >  1:422498/1‑59 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGa    >  1:1085362/1‑63 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGa    >  1:1240091/1‑63 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:259247/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:476979/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:411720/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:407785/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:368590/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:357730/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:354896/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:533927/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:225755/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:212165/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:200557/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1840646/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:182995/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1819953/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1755827/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1738916/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1690523/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:808804/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:967465/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:958161/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:938088/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:920481/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:899324/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:878144/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:849363/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:849287/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:813882/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:483544/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:805297/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:770310/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:726617/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:719092/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:684678/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:613803/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:603502/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1032766/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:519645/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1430106/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1506576/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:149120/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1188722/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1488904/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1468920/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1464011/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1224483/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1687637/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1181700/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1428396/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1417000/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1374872/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1249603/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1304447/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1276566/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1274763/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1110458/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1025609/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1036069/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1098309/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1652679/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:164558/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1105001/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1583961/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1533262/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1154093/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1154288/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1523011/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1168394/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1522355/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1178335/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1442158/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1073856/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1351885/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:364670/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:317641/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:271044/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:244370/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1529914/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:20837/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1867087/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1624377/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1664094/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:170252/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1700780/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAc   >  1:1694082/1‑64 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCAGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:420359/1‑65 (MQ=255) cGAATCATCTTGAGCGACAGTTAGCCGTAACGGAACCAAATAAg                       >  1:918535/1‑44 (MQ=38) cGAATCATCTCGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGAcc  >  1:1239183/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGAATCATCTTGAGCGACAGTTCGCCGTAACGGAACCAAATCAGGTGTGGTGCGGTGATGTGACC  >  W3110S.gb/271346‑271410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑