Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3127500	3127759	260	11 [0]	[0] 25	[glcC]–[yghO]	[glcC],[yghO]

ATGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCCGGCG  >  W3110S.gb/3127760‑3127824 |                                                                 aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:330853/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:955319/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:91522/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:890459/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:861206/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:853714/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:793406/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:657108/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:503094/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:488466/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:46390/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1096040/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:318459/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1651646/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1634109/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1514354/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1421684/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1395173/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1313039/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1257553/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1223212/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:1110684/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGTGTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:88743/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGGTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:253632/65‑1 (MQ=255) aTGTTATTCATGCCTGTATTGGGTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCcggcg  <  1:60885/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATGTTATTCATGCCTGTATTGGTTTCGAGGATCCATGACATCTCCAGCGCATCGATCTTCCGGCG  >  W3110S.gb/3127760‑3127824

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑