Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3131381	3131675	295	113 [0]	[0] 19	yghR	hypothetical protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain

CGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGA  >  W3110S.gb/3131676‑3131739 |                                                                cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:1179343/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:750958/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:680258/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:546162/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:492109/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:46253/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:449909/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:271850/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:238647/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:194141/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:1886521/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:180995/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:1566148/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:1323711/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:1315192/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:1103476/64‑1 (MQ=255) cGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTGGTTGCAGCGa  <  1:285338/64‑1 (MQ=255) cGCCGGCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTGGCAGCGa  <  1:449911/64‑1 (MQ=255) cGCCGGCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGGTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGa  <  1:751912/64‑1 (MQ=255) |                                                                CGCCGTCTTCGCCGGAGAGCAGCCCCAGATAGCGCCGCTCGGTTTGCCAGTGTTGTTGCAGCGA  >  W3110S.gb/3131676‑3131739

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑