Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3168102	3168233	132	31 [0]	[0] 36	ygiW	conserved hypothetical protein

TTGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAGGG  >  W3110S.gb/3168234‑3168298 |                                                                 ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:622249/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1807051/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:298759/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:313830/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:317614/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:373075/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:449457/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:500985/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:522244/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1799227/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:629936/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:664929/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:691490/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:801042/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:860834/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:905596/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:935641/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:998880/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1430434/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1094766/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1207322/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1249148/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1273309/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1281526/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:129757/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1408139/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1426224/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1047920/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1449620/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1481240/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1510184/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1525405/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1601386/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1605103/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAggg  <  1:1689169/65‑1 (MQ=255) ttGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTACGCTGCACAggg  <  1:1735737/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTGCGTTGCCGATGGGCCAGAAAAACCGCCCTGCTCTGCTGCCATCACCGGTGCGCTGCACAGGG  >  W3110S.gb/3168234‑3168298

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑