Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3187873	3187933	61	34 [0]	[0] 92	yqiG	predicted outer membrane usher protein

ACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTC  >  W3110S.gb/3187934‑3187997 |                                                                aCATCACCGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:88010/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGt                           >  1:181028/1‑39 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGt                           >  1:598991/1‑39 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGATTGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:212715/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAAt                     >  1:1739767/1‑45 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCgc     >  1:1567289/1‑60 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGCCTc  >  1:1461734/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGATTc  >  1:1571513/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACta  >  1:1072586/1‑63 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACt   >  1:634790/1‑63 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACt   >  1:645881/1‑63 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACt   >  1:1483932/1‑63 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACt   >  1:1278561/1‑63 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:431858/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:397071/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:427260/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:289864/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:462451/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:467342/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:314036/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:305338/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:507943/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:26704/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:261377/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:208432/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:197001/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1884363/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1873847/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1864233/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1855633/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:733104/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:997506/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:915879/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:888060/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:849552/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:835873/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:793818/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:776031/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:75348/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:750030/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:496556/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:727244/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:669229/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:649976/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:621366/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:587978/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:559719/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1820744/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:506901/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1310925/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1840860/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1447992/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1447413/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1432829/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1382713/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1382632/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1368052/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1349214/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1348029/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1323395/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1451881/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1293465/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1207271/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1173528/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1168362/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1120151/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1106999/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1076569/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1058614/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1034512/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1730978/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1837505/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1827853/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1004381/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1819837/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1819267/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1807404/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1796870/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1739794/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1475882/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1717018/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1713194/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:170562/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1705312/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1689578/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:162727/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1606378/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1596659/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:153223/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTAAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:1691723/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTATGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:853576/1‑64 (MQ=255) aCATCACAGCGAGACAGCTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTc  >  1:893484/1‑64 (MQ=255) |                                                                ACATCACAGCGAGACAGTTATTATTCTCTGAATGCCAGTTGGAATGGTTCATTCACTGCGACTC  >  W3110S.gb/3187934‑3187997

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑