Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3232966	3232985	20	3 [0]	[0] 96	ygjN	conserved hypothetical protein

TTTTAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCG  >  W3110S.gb/3232986‑3233050 |                                                                 ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCaa       >  1:599113/1‑60 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTcc   >  1:1662432/1‑64 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTcc   >  1:1211781/1‑64 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTcc   >  1:1776385/1‑64 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTcc   >  1:284325/1‑64 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTc    >  1:1512957/1‑63 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:405260/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:543944/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:505667/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:495256/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:459093/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:193985/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:452583/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:420047/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:417110/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:41124/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:281939/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:204711/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:363279/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:221689/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:352920/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:336275/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:330622/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:299845/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:275430/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:284432/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:737371/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:922741/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:903301/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:895887/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:89034/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:857295/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:813558/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:809138/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:806930/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:777513/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:763049/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:743030/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:531236/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:715872/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:694039/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:677314/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:653503/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:639577/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:623760/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:603628/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:596804/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:584925/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:565088/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1036172/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1179494/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1413216/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1411648/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1383242/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1369481/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:134271/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1318592/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1317373/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1266210/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1243038/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1205365/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1866945/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1142298/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1129907/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1109462/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1102897/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1102300/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1097998/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1083267/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1072746/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1056957/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1017675/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:145862/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1871777/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1845709/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1817228/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1812172/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1799567/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1782278/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1760489/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1711961/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1698625/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1687395/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:166472/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1659780/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1654782/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1637676/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1612495/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1589722/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:157161/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1554361/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1546419/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1504923/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:1427944/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTACg  >  1:1370424/1‑65 (MQ=255) ttttAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGAGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCg  >  1:927579/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TTTTAATGACTCAGGTTTTTTGAAATATCCCTTAGCAATCGTGTTCCCCAGAGCCACCAACTCCG  >  W3110S.gb/3232986‑3233050

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑