Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3237382	3237386	5	5 [0]	[0] 40	alx	predicted inner membrane protein, part of terminus

TGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGCC  >  W3110S.gb/3237387‑3237451 |                                                                 tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:771382/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:395668/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:412428/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:416654/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:418776/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:571747/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:684631/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:688796/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:698540/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:759796/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:3517/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:798499/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:82756/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:83915/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:84832/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:849085/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:914899/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:925770/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:952/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:993717/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1781299/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1311692/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1438027/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1479574/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1571765/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1676397/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1677567/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1684651/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1764500/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1770537/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:116169/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1783436/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1801218/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:1850137/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:224996/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:236520/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:240726/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:250640/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:268145/65‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGcc  <  1:322438/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TGTCGTTACTGTTTAACGCCGCTTTCTGGTGGTATCTGGTGCAAACCGAAGGTCGCGCCGTTGCC  >  W3110S.gb/3237387‑3237451

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑