Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3280323	3280376	54	14 [0]	[0] 66	agaV	N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIB component of PTS

TAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATG  >  W3110S.gb/3280377‑3280441 |                                                                 tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACACCAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1351347/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCaaa                  >  1:1605616/1‑49 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCaaa                  >  1:178968/1‑49 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:538180/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:637238/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:501891/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:416657/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:416410/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:388395/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:369011/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:359011/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:33769/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:321376/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:29122/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:283768/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:264210/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:251078/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:218873/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:747406/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:96941/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:952291/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:939323/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:875963/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:84151/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:785203/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:753733/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:751395/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:570145/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:731518/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:69958/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:678692/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:677787/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:673525/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:644063/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1869400/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1523152/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1086045/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1125424/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1131226/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1138925/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1222667/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1259178/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1296934/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1322007/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1360225/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1381406/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1386093/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1387281/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1396716/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1470363/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1482926/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1878403/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1523701/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1571224/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1595326/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1596970/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1608347/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1660835/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1713354/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1737318/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1741217/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1741280/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1856279/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATg  >  1:1062726/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTATGGATg  >  1:1838470/1‑65 (MQ=255) tAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTCCTGTGGATg  >  1:1789034/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TAACGTTGGCAATATGCACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATG  >  W3110S.gb/3280377‑3280441

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑