Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3286896	3286948	53	56 [0]	[1] 24	agaI/yraH	galactosamine‑6‑phosphate isomerase/predicted fimbrial‑like adhesin protein

ATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGA  >  W3110S.gb/3286937‑3287012             |                                                                atatTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCaa                                 <  1:525198/45‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:435028/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:992528/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:984840/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:934729/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:830890/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:768523/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:718787/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:61722/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:585144/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:495118/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1065129/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:40553/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:353485/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1757325/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1614829/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1597835/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1571891/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1512452/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1425439/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1314073/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1204587/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:1200490/64‑1 (MQ=255)             aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGATCAACAATTTAATTTTAGa  <  1:921715/64‑1 (MQ=255)             |                                                                ATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGA  >  W3110S.gb/3286937‑3287012

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑