Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3290464	3290486	23	79 [0]	[0] 55	yraJ	predicted outer membrane protein

GGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAA  >  W3110S.gb/3290487‑3290551 |                                                                 ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAGGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:188263/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACACCCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:297086/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:573189/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1833376/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1842367/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:186016/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:25711/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:2675/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:433560/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:484387/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:511116/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:513741/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:51407/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:536499/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1824875/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:617104/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:656457/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:675555/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:68735/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:696368/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:832509/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:834597/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:852972/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:871301/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:885494/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:912075/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:926490/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:994873/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1462721/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1033097/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1103902/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:113112/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1154193/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:124238/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1264821/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1270479/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1298893/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1300526/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1357831/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1368210/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1394115/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1424050/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1015718/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1471713/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1481690/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1538366/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1540523/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1559058/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1604909/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1625025/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1678119/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1698988/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1759653/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1777790/65‑1 (MQ=255) ggTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGaa  <  1:1806372/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GGTCGCCTGAGCTATAGCCTGGAACAAAGTCTGGATGACGATAACAACCATAACAGTAGCCTGAA  >  W3110S.gb/3290487‑3290551

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑