Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3290552 3290779 228 61 [0] [0] 174 yraJ predicted outer membrane protein

Only 100 of 174 total aligned reads displayed.

GGTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATA  >  W3110S.gb/3290780‑3290844
|                                                                
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGAtactac                >  1:1249378/1‑51 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGAtacta                 >  1:210486/1‑50 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGc              >  1:691482/1‑53 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGcc       >  1:1406476/1‑60 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:312423/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:1486367/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:512722/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:1570980/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:470097/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:417785/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:1058181/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:227087/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGAt   >  1:797873/1‑64 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:235006/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1883293/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:196507/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:503177/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:498823/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:20423/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:441913/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:426022/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:242785/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:344502/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:343290/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:329045/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:540288/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:306117/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:28039/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:301630/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:725760/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:99405/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:980877/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:954504/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:946058/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:93339/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:888850/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:850501/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:837422/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:783172/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:774559/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:747523/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:518972/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:714237/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:711219/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:686781/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:642078/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:631527/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:563585/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:560404/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:550589/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1862625/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:529408/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1325776/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1867528/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1452921/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1450461/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1447481/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1424611/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1403112/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1388015/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:137753/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:135124/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1347010/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1343901/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1455726/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1265675/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1207699/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:119202/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1176987/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1146101/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1141862/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1098709/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1083523/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:104515/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1016748/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1000677/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1731932/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1866466/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1000586/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1834670/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1817793/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1804650/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1802973/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1795440/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1792806/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1752438/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1742032/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1476137/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1719123/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1678547/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1676354/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1670155/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1621593/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1593463/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1593043/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1564036/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:151005/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1502647/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATa  >  1:1480995/1‑65 (MQ=255)
ggTTCCGTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGcc       >  1:852758/1‑60 (MQ=255)
|                                                                
GGTTCCTTATCTCACAACTTATCAGGAAAACCGTCTCTCGGTAGATACTACGCAGCTGCCCGATA  >  W3110S.gb/3290780‑3290844

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: