Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	293504	293505	2	140 [0]	[0] 30	yagM	hypothetical protein

TAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTT  >  W3110S.gb/293506‑293570 |                                                                 taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGc                               >  1:282654/1‑36 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCAc               >  1:1503965/1‑52 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCAc               >  1:288431/1‑52 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:230304/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:999465/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:763932/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:664106/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:662675/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:651636/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:571908/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:5314/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:426309/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:38055/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:349948/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:286236/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:27617/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1167849/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1841398/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1788391/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1776163/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1642650/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1601828/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1433174/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:128110/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttt  >  1:1190486/1‑65 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGttt   >  1:1767097/1‑64 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGttt   >  1:1731482/1‑64 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGttt   >  1:1561046/1‑64 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGttt   >  1:1242989/1‑64 (MQ=255) taaatgGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGttt   >  1:1221721/1‑64 (MQ=255) |                                                                 TAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTT  >  W3110S.gb/293506‑293570

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑