Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	295767	295813	47	157 [0]	[0] 70	intF	predicted phage integrase

ATCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCT  >  W3110S.gb/295814‑295877 |                                                                aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:445688/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:573970/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:572208/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:562007/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:56168/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:553188/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:514045/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:511966/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:488553/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:574377/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:440467/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:42502/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:408064/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:395683/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:395387/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:356237/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:338573/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:314353/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:721182/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:992726/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:928193/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:91054/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:886204/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:861179/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:768520/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:757164/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:746097/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:31028/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:692011/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:650090/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:639756/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:609265/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:596964/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:58704/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:585279/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1330357/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1454274/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1449609/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1407695/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1388562/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1383607/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1374618/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1369456/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1367431/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1460844/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1320823/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1300164/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1295296/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1201480/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1193743/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1180432/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1132679/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1100875/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1812208/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:261516/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:222146/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:22043/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:198620/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:190556/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1863169/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1861884/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1830262/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1098624/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1775350/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1717704/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1699980/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1553255/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1534513/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1472838/64‑1 (MQ=255) aTCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCt  <  1:1469092/64‑1 (MQ=255) |                                                                ATCGGCAATGTATCGAGTAGAATATGGGCGTTTAGTTTTTGCACTGATACCGGTTCTCAATTCT  >  W3110S.gb/295814‑295877

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑