Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3329689	3329717	29	132 [0]	[0] 73	dacB	D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase

ATTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATGCGCG  >  W3110S.gb/3329718‑3329782 |                                                                 aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgctcg  <  1:244129/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgctcg  <  1:4028/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:475093/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:567548/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:52168/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:515922/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:513788/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:505684/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:496746/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:489857/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:487048/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:576048/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:387443/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:331876/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:331619/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:254029/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:25111/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:235731/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:788837/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:99703/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:982671/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:964215/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:94096/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:930812/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:834407/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:82610/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:813921/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:19559/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:780540/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:774705/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:759014/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:752325/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:749414/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:698847/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:631093/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:610493/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1413139/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1554517/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1525151/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1501698/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1467288/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1466970/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1450885/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1450094/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1437191/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1557754/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1376765/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:132307/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:130453/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1293235/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:128264/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1218766/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1185968/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1176553/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1658297/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1834884/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1832757/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:180541/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1793521/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1760627/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1750330/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1703885/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1699946/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1687473/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1015039/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1602038/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1594859/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1594807/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1591635/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1587442/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1579733/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:1573162/65‑1 (MQ=255) aTTATGCTGAAAAAGTCCGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATgcgcg  <  1:635537/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATTATGCTGAAAAAGTCGGACAACATGATCGCCGATACGGTTTTCCGCATGATAGGCCATGCGCG  >  W3110S.gb/3329718‑3329782

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑