Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3331877	3331961	85	48 [0]	[0] 45	yhbE	conserved inner membrane protein

ACTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAG  >  W3110S.gb/3331962‑3332011 |                                                  aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGGGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:184269/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:730281/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:38573/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:396413/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:400540/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:40345/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:517567/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:594730/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:616683/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:680595/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:721377/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:72880/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:968492/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:785322/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:785793/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:802041/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:819617/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:831453/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:841019/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:859831/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:861214/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:952812/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1040842/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1539287/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1069908/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1146237/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1151114/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1153665/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:119029/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1234481/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1270672/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1363371/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1472035/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:14994/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1805051/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1543576/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1566025/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1645833/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1736168/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1748464/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1784523/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:179777/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:1798489/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGCGTACAg  <  1:668541/50‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCTTTGCCAGAGGAAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAg  <  1:169289/50‑1 (MQ=255) |                                                  ACTCCAGGCTTTGCCAGAGGGAAGAGCGCAATTGTACATAAAGTGTACAG  >  W3110S.gb/3331962‑3332011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑