Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	297098	297248	151	7 [1]	[0] 43	yagQ	conserved hypothetical protein

CAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCGCTGG  >  W3110S.gb/297249‑297313 |                                                                 cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGa                                >  1:435739/1‑35 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGAccgcc                           >  1:1848395/1‑40 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGGgctgg  >  1:1801967/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:648181/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:358307/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:386728/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:423845/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:465540/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:47461/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:536618/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:597093/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1019314/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:66392/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:698554/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:761241/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:809793/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:819301/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:821541/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:835628/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:843256/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:916820/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:288416/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1006723/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1025779/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1092547/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:117874/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1179294/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1185720/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:128975/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1296544/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1343784/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1344396/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:138473/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1588548/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1787994/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:197224/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:225312/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:305332/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctg   >  1:415221/1‑64 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctg   >  1:982269/1‑64 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACAGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:235590/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAAAGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCgctgg  >  1:1503562/1‑65 (MQ=255) cAGCTCCCGGTTGAGATCAAGGCACAGCAAAATGAccgc                            >  1:527814/1‑39 (MQ=255) |                                                                 CAGCTCCCGGTTGAGATCATGGCACAGCAAAATGACCGCCGTATCGGTATCGATCTGAGCGCTGG  >  W3110S.gb/297249‑297313

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑