Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3376815	3376933	119	10 [0]	[0] 22	sspA	stringent starvation protein A

CATCAGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCG  >  W3110S.gb/3376934‑3376998 |                                                                 catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1765274/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:918465/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:862102/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:854816/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:853914/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:657448/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:454856/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:454343/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:276490/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:261993/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1780263/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1019718/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1765203/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:175848/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1758149/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1703577/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1556255/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1454587/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1344260/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1164012/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1090493/65‑1 (MQ=255) catcaGCGTGAACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCg  <  1:1210799/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CATCAGCGTGTACCAGTCTTTTTCGATGCGATGCATGTACAGACGGCTTTCACCGCGAGCTACCG  >  W3110S.gb/3376934‑3376998

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑