Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3381008 3381214 207 2 [0] [1] 89 degQ serine endoprotease, periplasmic

ATGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCA  >  W3110S.gb/3381214‑3381279
 |                                                                
aTGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCTGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1503858/65‑1 (MQ=38)
 tGCTTCCATTAACCGCTGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1553132/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCTGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:200086/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACTGTGAGTTAATTGGCa  <  1:484426/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:339492/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:481117/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:476518/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:446684/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:415066/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:414038/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:382248/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:360878/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:358944/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:504300/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:337953/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:337891/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:265464/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:240276/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:192546/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1843928/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1839771/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1839402/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1827156/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:691467/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:970247/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:931604/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:915829/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:898008/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:897475/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:896817/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:814668/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:773791/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:752826/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:741718/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:694015/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:178289/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:67613/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:649950/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:618043/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:584312/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:583423/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:540669/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:532005/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:51579/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:512844/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:511543/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1214424/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1359583/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1357891/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:134751/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1330056/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1325583/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1323134/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1310855/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1283664/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1248600/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1232584/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1376117/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:120446/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1199285/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1180797/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1111775/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1093037/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:109245/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1057793/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1056420/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1053924/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1030574/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1558675/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1018906/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1719899/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:169288/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1666001/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1645624/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1615668/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1587737/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1577893/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1575863/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1559130/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1790052/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1518560/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1507220/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1504731/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1487477/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1481728/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1419733/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1415494/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:1386970/65‑1 (MQ=255)
 tGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCa  <  1:137923/65‑1 (MQ=255)
 |                                                                
ATGCTTCCATTAACCGCGGTAACTCCGGCGGTGCACTATTAAACCTTAACGGTGAGTTAATTGGCA  >  W3110S.gb/3381214‑3381279

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: