Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3386204	3386589	386	7 [0]	[0] 83	aaeB	p‑hydroxybenzoic acid efflux system component

CTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCT  >  W3110S.gb/3386590‑3386654 |                                                                 cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTTCt  <  1:241315/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:393570/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:705809/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:566912/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:56265/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:539699/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:53058/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:523245/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:495920/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:48372/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:460862/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:45970/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:706542/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:385523/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:382535/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:380884/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:369748/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:331847/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:305221/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:285196/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:281162/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:832931/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:988085/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:982784/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:981783/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:956744/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:950195/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:921324/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:896847/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:870708/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:857118/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:834669/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:249011/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:805660/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:799761/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:796621/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:793318/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:782923/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:778351/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:738838/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:723920/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:719047/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1229434/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1485341/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1481759/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1462758/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1455212/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1435572/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1368255/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:136824/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1359994/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1237274/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1232232/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1497603/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1215930/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1206511/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1182129/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1159912/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1143665/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1127813/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1121110/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1072474/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1064202/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1741587/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1062247/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:238522/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:209608/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:198149/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1846706/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1782881/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1769949/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1752105/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1750068/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:273886/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1706262/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1703675/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1661613/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1584399/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1578871/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1559076/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1542629/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1513191/65‑1 (MQ=255) cTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCt  <  1:1507458/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTGTCGAGAAACTGACTGAAATGGAAAGTCATCGGGTTATCCAGCACGATAATATTTATGGTGCT  >  W3110S.gb/3386590‑3386654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑