Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3417170	3417198	29	55 [0]	[0] 9	acrF	multidrug efflux system protein

ATGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAG  >  W3110S.gb/3417199‑3417262 |                                                                aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:1027093/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:1560309/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:1590031/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:1662778/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:169951/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:1746143/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:1809803/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:1861704/64‑1 (MQ=255) aTGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGGCGATAAACTTTATGTCCGCAg  <  1:463652/64‑1 (MQ=255) |                                                                ATGTTCAGGCGGATGCCAAATTCCGTATGCTGCCAGAAGATGTCGATAAACTTTATGTCCGCAG  >  W3110S.gb/3417199‑3417262

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑