Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3446798	3446884	87	162 [0]	[0] 39	htrC	heat shock protein

TCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTG  >  W3110S.gb/3446885‑3446949 |                                                                 tCCTGTTTCTTTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:637668/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:508429/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:194639/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:205863/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:213554/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:256261/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:322059/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:387426/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:418039/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:460222/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:47583/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1774525/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:517388/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:689070/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:758875/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:762496/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:789734/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:841682/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:955022/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1601630/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:115512/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1163790/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1187076/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1267348/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1282483/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1349897/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:139971/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1404530/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1421042/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1438514/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1441912/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:145428/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1488409/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1489131/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1492335/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1503087/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1549854/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTg  <  1:1053753/65‑1 (MQ=255) tCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTCTg  <  1:4806/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TCCTGTTTCATTCTCGTTCCTTAAGAAAGTTACACAGGAATAGTATCGAATCCTTGCCGAGTTTG  >  W3110S.gb/3446885‑3446949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑