Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3451503	3451515	13	52 [1]	[0] 41	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

GTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGG  >  W3110S.gb/3451516‑3451580 |                                                                 gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAtgg  <  1:3896/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAgtg  <  1:1841768/65‑3 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:626641/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:232086/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:292176/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:338452/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:396728/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:471338/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:492277/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:499098/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:513941/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:224371/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:696984/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:747612/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:753856/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:755961/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:807377/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:841716/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:893388/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:909083/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:937951/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1412192/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1039526/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1085958/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:109776/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1135502/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1228862/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1264920/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1279700/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1286862/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1399450/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1002090/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1501332/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1511243/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1513723/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1520265/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1522555/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1780234/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:1852132/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:221617/65‑1 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTAACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAggg  <  1:298238/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGG  >  W3110S.gb/3451516‑3451580

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑