Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3487091	3487093	3	7 [0]	[0] 42	yijP	conserved inner membrane protein

AATTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTG  >  W3110S.gb/3487094‑3487141 |                                                aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTCGTGCTGGTg  >  1:447371/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:659459/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1870809/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:322736/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:334583/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:347458/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:361401/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:372000/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:424522/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:562306/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:612332/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1830317/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:660067/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:678341/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:698926/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:733222/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:741865/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:820116/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:923336/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:933774/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:973828/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:143858/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1029699/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1048108/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1060909/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1063125/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1092148/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1180685/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1221398/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1271647/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1283447/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1433810/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1015554/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1440703/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1495905/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1531278/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1538323/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1620767/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1644851/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1753431/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1762477/1‑48 (MQ=255) aaTTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTg  >  1:1797580/1‑48 (MQ=255) |                                                AATTTCAAAGATGAATCGGGTAACGAACCGCGCACTTTAGTGCTGGTG  >  W3110S.gb/3487094‑3487141

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑