Missing coverage evidence...
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TTACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCA  >  W3110S.gb/3510544‑3510606 |                                                               ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTgg                       >  1:1464704/1‑42 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAGAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:210999/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGcc  >  1:983566/1‑62 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:499692/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:177057/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:178645/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1855511/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:330668/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:38084/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:401728/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:468844/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:475260/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1751569/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:570978/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:622276/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:62654/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:649820/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:759996/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:910186/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:9241/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:984818/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1414537/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1015977/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1094609/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1117179/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1117761/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1174721/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1195474/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1214911/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1389889/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:13987/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1405838/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1014669/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1480306/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1500673/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1552486/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1653444/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1694190/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1710716/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1745562/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1748461/1‑63 (MQ=255) ttACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGAACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCa  >  1:1842632/1‑63 (MQ=255) |                                                               TTACCGGTTCCGGTAAAACGGAGGTTTATCTCAGCGTACTGGAAAACGTGCTCGCTCAGGGCA  >  W3110S.gb/3510544‑3510606

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑