Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3524419 3524437 19 80 [0] [0] 162 yiiR/yiiQ conserved inner membrane protein/conserved hypothetical protein

Only 100 of 162 total aligned reads displayed.

GGAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGT  >  W3110S.gb/3524438‑3524502
|                                                                
ggAGCCAGTCATAACAATAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1435131/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:347763/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:492438/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:463045/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:460020/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:445136/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:439322/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:437472/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:435632/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:43105/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:396986/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:387962/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:361736/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:532313/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:334278/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:296735/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:296150/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:278840/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:253983/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:252836/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:216018/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:215924/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1861356/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1831988/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1827596/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1804607/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:74942/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:99293/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:961178/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:957278/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:947986/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:909093/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:881753/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:878021/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:813207/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:806138/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:786930/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:768925/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1799271/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:745672/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:725929/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:682247/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:674887/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:651645/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:645915/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:629898/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:600948/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:590174/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:569519/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:543138/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1208377/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1005549/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1458036/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1453735/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1435165/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1420457/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1392772/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1368786/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1347369/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1316376/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:13085/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1242053/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1232099/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1490389/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1180457/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1178478/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:114047/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1127369/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1111890/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:110313/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1098353/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1049474/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1041112/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:104087/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1036578/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1625592/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1763926/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1743337/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1741670/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1733946/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1721286/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1720629/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1706574/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1694029/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1685050/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1663103/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1656865/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1495117/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1619016/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1616387/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1598119/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1594325/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1583883/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1548714/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1543206/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1538646/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1515334/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1510709/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:1501181/65‑1 (MQ=255)
ggAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGGGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGt  <  1:78971/65‑1 (MQ=255)
|                                                                
GGAGCCAGTCATAACAAAAGGTACTGTCAATGAAGCCAGGGTGTACGCTGTTTTTTCTCTTATGT  >  W3110S.gb/3524438‑3524502

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: