Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3535729	3535992	264	23 [0]	[0] 34	[sodA]	[sodA]

TTTGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAT  >  W3110S.gb/3535993‑3536056 |                                                                tttGCAGGATAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1367630/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCCCCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1260726/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:813486/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:448745/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:466647/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:577207/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:652416/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:748138/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:751779/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:784444/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:808465/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:362133/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:831767/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:843008/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:857305/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:936254/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:975951/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:990904/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:363301/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1018732/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:359985/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:35112/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:341949/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:316801/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1879560/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1836411/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1807294/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1774869/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1596513/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1572339/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1568672/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:143270/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1217253/64‑1 (MQ=255) tttGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAt  <  1:1171265/64‑1 (MQ=255) |                                                                TTTGCAGGAAAATGCCCGAGATGTGAAGCAAATCACCCACTTAATGCCGTGATTGCCAGTAAAT  >  W3110S.gb/3535993‑3536056

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑