Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3539924	3540075	152	29 [0]	[0] 31	rhaB	rhamnulokinase

ACCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATG  >  W3110S.gb/3540076‑3540126 |                                                   aCCAATGAAGGCGGGGCTGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1494489/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCTCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:926871/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:306379/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:977815/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:90027/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:87796/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:746211/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:704460/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:676207/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:637457/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:614005/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:604743/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:51192/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:445635/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:370355/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:369217/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1001376/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:298556/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:286530/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:213480/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1844597/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:175474/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1719909/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1677057/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1420766/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1408600/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1391185/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1203168/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:1147623/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTAAAAAATATTATg  <  1:165416/51‑1 (MQ=255) aCCAATGAAGGCGGGCCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATg  <  1:577573/51‑1 (MQ=255) |                                                   ACCAATGAAGGCGGGGCGGAAGGTCGCTATCGGGTGCTGAAAAATATTATG  >  W3110S.gb/3540076‑3540126

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑