Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3540933	3541131	199	16 [0]	[0] 31	rhaA	L‑rhamnose isomerase

TTACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAT  >  W3110S.gb/3541132‑3541178 |                                               ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCGTTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1722746/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCt          >  1:247317/1‑39 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1751945/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:992474/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:982151/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:971688/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:88123/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:68485/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:668/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:665114/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:645625/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:595261/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:533177/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:466599/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:299485/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:25296/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1853478/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1009399/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1654117/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1653955/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1600698/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1542328/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:14293/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1408194/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1328502/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1257036/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1246913/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:123540/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1205696/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:1061104/1‑47 (MQ=255) ttACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAt  >  1:101944/1‑47 (MQ=255) |                                               TTACGCTTTCCCATGCCGACGACAGCATTCGCCAGTTCTGGATTGAT  >  W3110S.gb/3541132‑3541178

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑