Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3541697	3541890	194	64 [0]	[0] 36	rhaA	L‑rhamnose isomerase

CAGCAGGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCGGG  >  W3110S.gb/3541891‑3541955 |                                                                 cagcggGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:827246/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCTAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:298489/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:509978/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:508303/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:57244/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:639398/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:669370/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:688674/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:709174/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:799300/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:81384/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:83101/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:845134/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:847122/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:851084/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:869664/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:908099/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:923234/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:998874/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1682426/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1066503/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:107987/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1275787/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1328301/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1340928/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1343343/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1402833/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1521442/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1062371/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1736237/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1776427/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:1854063/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:243754/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:374359/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:405639/65‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCggg  <  1:501783/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CAGCAGGTAGCGAATGGCTGGAGAGCGTGCGGGCTTATGAGAAAGAAATTTTGAGTCGCCGCGGG  >  W3110S.gb/3541891‑3541955

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑