Missing coverage evidence...
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TTTGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGCC  >  W3110S.gb/320252‑320316 |                                                                 tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:689524/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:225012/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:227581/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:250545/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:313422/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:316932/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:53246/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:550142/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:633055/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:670010/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:202776/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:720070/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:723882/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:758257/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:792412/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:832125/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:894883/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:922447/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:955427/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:995192/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1390853/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1007718/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:108085/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1125769/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1178566/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1223072/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1291140/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1302960/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1318887/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:132274/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1003275/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1403180/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1450467/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1479449/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1481955/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1560578/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1792607/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:1799462/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:18491/65‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGcc  <  1:194655/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTTGGTTGTACCCCGGGAGAATATCGGGAAAGGGTCAGACAGCTTGCACCCTGAATAAAACCGCC  >  W3110S.gb/320252‑320316

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑