Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3676204	3676212	9	153 [0]	[0] 56	rep/yifN	DNA helicase and single‑stranded DNA‑dependent ATPase/ECK3769:JW3750:b3777; conserved hypothetical protein

GTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAC  >  W3110S.gb/3676213‑3676277 |                                                                 gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGa                  >  1:890454/1‑49 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTaa   >  1:10866/1‑64 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTaa   >  1:1326225/1‑64 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTaa   >  1:1754922/1‑64 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTaa   >  1:853243/1‑64 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:59300/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:696397/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:53836/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:491579/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:465361/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:454555/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:436128/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:426388/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:411808/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:345828/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:242354/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:23761/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:626796/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:669624/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:198288/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:703797/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:728621/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:85708/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:857747/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:86010/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:892626/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:976698/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:983682/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:989324/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1443044/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1049697/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1110190/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1118308/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1132184/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1133147/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1164696/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1211179/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1249217/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1268244/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:129429/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:13150/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1355865/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1389727/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:200645/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:144686/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1474847/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:150239/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1628304/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1662606/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1692543/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1759499/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1784772/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1829403/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1875618/1‑65 (MQ=255) gTTTACTCGTGGCGATTAAATTCAGCCCTAAGGTTgg                              >  1:584228/1‑37 (MQ=255) gTTTACTCGTGACGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAc  >  1:1007644/1‑65 (MQ=255) |                                                                 GTTTACTCGTGGCGATTAATTTCAGCCCTAAGGTTGGTGAAATACTGGAATGCAACTTTGGTAAC  >  W3110S.gb/3676213‑3676277

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑