Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3685318	3685333	16	69 [0]	[0] 16	ilvG	Mutation in protein compared to W3110: p.Glu327_Ilefs*223 Restoration of IlvG found in MG1655 (548 amino acids), fusion of N‑ter and C‑ter fragments ECK3760:JW3740+JW3741:b4488; large subunit of acetolactate synthase II

CGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGC  >  W3110S.gb/3685334‑3685369 |                                    cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1110446/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1116142/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1231745/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1459669/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1475330/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1489108/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1499903/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1597075/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:1732687/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:392336/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:650299/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:695170/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:736002/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:802720/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:878771/36‑1 (MQ=255) cGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGc  <  1:974413/36‑1 (MQ=255) |                                    CGCACTCCTGCACCGCGAAGTTCGCCGCTTTGGTGC  >  W3110S.gb/3685334‑3685369

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑