Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3755718	3755802	85	2 [0]	[0] 55	rnpA	protein C5 component of RNase P

GAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGAA  >  W3110S.gb/3755803‑3755867 |                                                                 gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCGCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:270309/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:578287/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1836611/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1851436/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1884688/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:268369/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:290755/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:304630/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:313002/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:334580/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:351563/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:355090/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:49176/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:551792/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1829835/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:607072/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:67792/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:687886/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:717670/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:736062/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:737066/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:747793/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:79238/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:840767/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:843937/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:916702/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:963609/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1482041/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1038880/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1040733/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1047361/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1058470/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1072915/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1161349/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1161878/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1184882/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1211416/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1236243/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1393291/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:143872/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1448415/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1023969/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1562388/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1565791/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1589705/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1628399/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1641167/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1654739/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1668639/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1668909/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1696329/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1699655/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1706674/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:1759323/65‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGGGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGaa  <  1:509463/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GAATTCAGGCGGCCGAGAATGGTAATTTGCGGCGTGCCAGCCCGTTGTGGCTGCTGGAAGACGAA  >  W3110S.gb/3755803‑3755867

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑