Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3777632	3777774	143	13 [0]	[0] 93	glvC	arbutin specific enzyme IIC component of PTS

TGGGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACAC  >  W3110S.gb/3777775‑3777839 |                                                                 tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGt                               >  1:1120950/1‑36 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCAtt                          >  1:887478/1‑41 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTg              >  1:179987/1‑53 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGt             >  1:1534473/1‑54 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:45586/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:472889/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:443915/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:42555/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:409667/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:378954/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:359163/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:297916/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:268203/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:265180/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:240272/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:230073/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:212154/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:205351/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:202808/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:202436/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:196461/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:193285/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:190109/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:182483/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:653014/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:9965/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:947258/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:887702/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:87162/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:850259/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:848441/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:825778/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:7513/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:681606/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:67929/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:456975/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:645420/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:631284/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:62808/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:620075/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:600146/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:565674/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:535538/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:493743/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:481680/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1800015/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1186886/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1026513/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1436565/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1435230/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1409951/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1337835/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1334015/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1333406/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:132840/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1305726/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1249843/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1191482/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1453943/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1170010/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1154487/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1123674/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1105075/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1090076/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1076486/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1065298/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1055814/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:103658/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1028158/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1658821/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:178906/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1737417/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1705167/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1688619/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1687983/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1685875/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1680143/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1665105/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1505964/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1581108/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1567836/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1554873/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1548412/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1532124/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1524957/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1519472/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1513915/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1507812/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTaca   >  1:385983/1‑64 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTCCTGTTTGCGGTacac  >  1:571842/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTAACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:223085/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTGCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:1722888/1‑65 (MQ=255) tggGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCAGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTacac  >  1:893022/1‑65 (MQ=255) |                                                                 TGGGAATTACCGAACCGCTGGAATTTACCTTCCTGTTCATTTCACCGTTGCTGTTTGCGGTACAC  >  W3110S.gb/3777775‑3777839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑