Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3836687	3836938	252	40 [0]	[0] 70	rfaB	UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase

CGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGC  >  W3110S.gb/3836939‑3837003 |                                                                 cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTgg   >  1:1769063/1‑64 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTgg   >  1:1424348/1‑64 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:378321/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:42462/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:421707/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:416217/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:415261/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:412099/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:408445/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:39961/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:39951/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:520230/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:263600/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:259491/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:257373/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:245140/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:232795/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:222992/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1874174/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:721954/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:962271/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:891342/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:890739/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:870612/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:817939/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:802132/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:800129/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:722903/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1833788/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:718833/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:684061/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:682798/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:681547/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:563327/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:532888/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:530457/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1165391/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1369100/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1366097/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:132120/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1321197/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1222963/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1213091/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1175435/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1172755/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1429203/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1164602/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1146129/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1113872/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1085496/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1071541/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1053828/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1052662/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1594480/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1042700/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1760/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1700866/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1670217/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1668618/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1647185/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1600193/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1595375/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1871714/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1588994/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1562147/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:147496/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1474206/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1436332/1‑65 (MQ=255) cGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1434520/1‑65 (MQ=255) cGAAAAAGGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGc  >  1:1436594/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGAAAAATGCCAGGCTTATGGTAGAGAATTAAATATTGATGATCGAATTGTCTGGTATGGTTGGC  >  W3110S.gb/3836939‑3837003

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑