Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3840901	3841005	105	109 [0]	[0] 48	rfaZ	lipopolysaccharide core biosynthesis protein

AGAATCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCTAATT  >  W3110S.gb/3841006‑3841070 |                                                                 agaaTCAAAAGATATTACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1401954/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAAc                         >  1:1564746/1‑42 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCg                 >  1:783994/1‑50 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:547251/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1007450/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:184270/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1876946/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:234148/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:429197/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:429469/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:493989/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:519208/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:525470/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:533088/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1801216/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:551788/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:566793/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:584397/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:665181/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:667494/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:708886/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:833348/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:921186/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:992521/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1432927/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1043857/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1084451/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1108881/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1141922/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1178985/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1205559/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1272110/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:131631/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1350202/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1800209/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1435778/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:15207/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:154847/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1604679/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1662100/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1675403/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:171882/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1747051/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaatt  >  1:1786844/1‑65 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaat   >  1:1139784/1‑64 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCtaat   >  1:935569/1‑64 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCta     >  1:1853586/1‑62 (MQ=255) agaaTCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGAAATATAGAACTTc                      >  1:186605/1‑45 (MQ=255) |                                                                 AGAATCAAAAGATATGACAAGAAAAAAAATGCAATATAGAACTTCAACCGATTCTTATGCTAATT  >  W3110S.gb/3841006‑3841070

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑