Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3841601	3842025	425	32 [0]	[0] 29	rfaK	lipopolysaccharide core biosynthesis

TCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAA  >  W3110S.gb/3842026‑3842088 |                                                               tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGACTCATCATAAATCTATACaa  <  1:1727097/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1813911/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:766541/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:750188/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:643647/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:599756/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:554065/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:519023/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:455403/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:296880/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:20902/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:204152/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:183384/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1012690/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1806207/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1712009/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:165535/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1420573/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1411062/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1365148/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1326365/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:123425/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1224314/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1207640/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1164227/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCCATACaa  <  1:193601/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATATGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1091916/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCGGAATACCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:1848334/63‑1 (MQ=255) tCACGTACTCCAGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACaa  <  1:236302/63‑1 (MQ=255) |                                                               TCACGTACTCCGGAATATCCCTCGCATTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAA  >  W3110S.gb/3842026‑3842088

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑