Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3844846 3844852 7 134 [0] [0] 96 rfaF ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II

TTCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCAA  >  W3110S.gb/3844853‑3844917
|                                                                
ttCATCAATCATCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGAGGt                             >  1:765537/1‑38 (MQ=25)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAgt                          >  1:435225/1‑41 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAgt                          >  1:77895/1‑41 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGtgtg                       >  1:1544852/1‑44 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCa                   >  1:1477541/1‑48 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCg                >  1:1018945/1‑51 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:354899/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1857010/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:556350/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:535405/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:534437/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:490293/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:429026/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:390309/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:377903/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:372256/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:190343/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:999567/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1862542/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:332190/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:3187/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:310864/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:255553/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:247413/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:234259/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:199491/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:199483/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:80495/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1010183/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:999358/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:98063/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:942539/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:907926/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:887054/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:878261/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:864688/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:860624/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:851716/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:593156/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:745328/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:734969/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:73114/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:719249/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:7118/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:702988/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:695294/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:67706/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:624331/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1363063/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1855481/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1499010/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:147882/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1472538/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:141232/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1407428/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1396282/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1393101/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1389637/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1379352/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1370927/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1509690/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1302393/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:12421/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1239990/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:122986/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1217701/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1190685/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1188046/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1130946/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1063116/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1030513/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1714807/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:184888/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1824751/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1808360/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1779497/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1749910/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1746943/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1742107/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1722769/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1553937/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1711909/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1702577/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1687681/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1645068/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1637489/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1618395/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:161467/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1568458/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCa   >  1:1692357/1‑64 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCa   >  1:397703/1‑64 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCa   >  1:223436/1‑64 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCa   >  1:948164/1‑64 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCAGGACCaa  >  1:302982/1‑65 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGACGGACCa   >  1:1559631/1‑64 (MQ=255)
ttCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGAGGCCAGCGTTTTGCCGGACCaa  >  1:1294060/1‑65 (MQ=255)
|                                                                
TTCATCAATCAGCTGCTTTGCCAGCTCCGCATAGTGGTAGTGTGGCCAGCGTTTTGCCGGACCAA  >  W3110S.gb/3844853‑3844917

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: