Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3856554	3856618	65	66 [0]	[0] 62	secB	protein export chaperone

CGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTAA  >  W3110S.gb/3856619‑3856683 |                                                                 cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGcc        >  1:1027938/1‑59 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTac  >  1:487839/1‑64 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:20483/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:339419/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:271199/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:262650/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:23582/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:225589/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:208958/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:207160/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1749379/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:192785/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1861488/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1861445/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:177388/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1756820/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1020270/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:45806/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:537089/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:590546/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:610799/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:65323/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:662285/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:706077/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:779839/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:811862/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:824992/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:860903/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:876735/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:877241/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:892168/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1712355/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:100201/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1061439/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1066360/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1083377/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1091904/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1127315/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1194857/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1216325/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1248536/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1255820/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1288929/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1299259/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1421912/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1436498/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:148443/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1504468/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1547294/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1559754/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1600617/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1607756/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:161563/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1633525/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1635872/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1649407/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1651964/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1661426/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1664061/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1677729/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTaa  >  1:1727533/1‑65 (MQ=255) cGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTa   >  1:899027/1‑64 (MQ=255) |                                                                 CGTGAGTGCATCACCAGCATGGTATCCCGCGGTACATTCCCGCAACTGAACCTTGCGCCGGTTAA  >  W3110S.gb/3856619‑3856683

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑