Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3870660	3870787	128	95 [0]	[0] 37	yibH/yibG	hypothetical protein/conserved hypothetical protein

ATCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCCTTACTT  >  W3110S.gb/3870788‑3870851 |                                                                aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTCGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1708398/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:60780/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:371850/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:400407/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:432810/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:532608/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:550884/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:556840/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:587065/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:606746/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:326297/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:698249/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:704494/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:72282/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:765929/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:80830/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:809723/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:937982/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:992577/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:221721/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:12187/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1247962/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1328730/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1350867/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1385953/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1421782/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1464409/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1495976/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1500161/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1501727/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1608681/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1654944/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1750402/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1780549/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1869458/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:1053100/64‑1 (MQ=255) aTCAGCGGCAAGTTGGAGGGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCcttactt  <  1:688970/64‑1 (MQ=255) |                                                                ATCAGCGGCAAGTTGGAGTGGATTTAGATTTTTCAGATATGGTCTTATGATCTTTCCCTTACTT  >  W3110S.gb/3870788‑3870851

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑