Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3927699	3927725	27	78 [0]	[0] 68	yhjY	conserved hypothetical protein

GAAACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGT  >  W3110S.gb/3927726‑3927790 |                                                                 gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATTGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1864499/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAggg  <  1:427968/65‑2 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAggg  <  1:1144200/65‑2 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:197410/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:415269/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:398316/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:395767/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:327656/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:327046/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:307088/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:2532/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:464991/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1874535/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1866606/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1819540/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:181153/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1805328/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1787973/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1744331/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:520501/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:534414/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:54718/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:549094/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:652794/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:66801/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:724718/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:725293/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:782990/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:791717/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:846261/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:920086/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:920393/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:94718/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:987032/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1267790/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1006317/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1370626/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1364959/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1348806/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1328280/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1308590/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1290538/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1282792/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:137598/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1243915/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:121751/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1203427/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1161882/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1090162/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1081596/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1045950/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1645077/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1730512/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1728438/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1709196/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:170249/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:168342/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1677282/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1670133/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1387216/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1625768/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1598898/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1582922/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1545154/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1523306/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1455109/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:1454272/65‑1 (MQ=255) gaaACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCAGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGt  <  1:751438/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GAAACCCCTGTGGATGTGACCAGCAGTATGAGTATGGGCTGGAATTTTCCTTTATATGAACAGGT  >  W3110S.gb/3927726‑3927790

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑