Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3961110	3961336	227	9 [0]	[0] 65	[yhjH]	[yhjH]

GATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGA  >  W3110S.gb/3961337‑3961401 |                                                                 gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTACCGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:237607/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTc               >  1:1278466/1‑52 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATccc      >  1:43924/1‑61 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTg   >  1:34556/1‑64 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTg   >  1:78787/1‑64 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:364014/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:501315/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:498019/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:467716/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:426662/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:372816/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:364016/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:546376/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:32714/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:23221/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:226445/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:198608/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1830186/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:5225/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1799665/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:557978/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:560158/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:604041/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:693416/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:82591/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:828416/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:842892/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:845850/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:882191/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:890771/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:93903/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:997392/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:99908/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1521780/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1109647/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1121332/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1149508/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1180100/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1198683/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1237594/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1313434/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1347830/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1387765/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1423473/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:143053/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1438800/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1472013/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1496601/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1500941/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1827833/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1599242/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1623699/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1626274/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1650821/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1653092/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1679483/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1737403/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1747855/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1749087/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1768605/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1777982/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1791476/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1792920/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGa  >  1:1101081/1‑65 (MQ=255) gATCTATCAAACATGCGGGCGGGTAATGGCCGGGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATccc      >  1:1745989/1‑61 (MQ=255) |                                                                 GATCTATCAAACATGCGGGCGGTTAATGGCCGTGGAGCTATTAACGGTGGTCACGCATCCCTTGA  >  W3110S.gb/3961337‑3961401

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑