Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3962767	3962771	5	43 [0]	[0] 27	yhjG	predicted outer membrane biogenesis protein

ATAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGCTC  >  W3110S.gb/3962772‑3962836 |                                                                 aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCTGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1372129/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGTCTGATTTCCGctc  <  1:621629/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:175552/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:95260/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:864069/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:777622/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:71719/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:560513/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:559183/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:54174/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:531201/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:513684/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:228851/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1868135/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1857922/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1044044/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:172530/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1651284/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1544378/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1442818/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1429955/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1374326/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1313021/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1283477/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1260051/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1240377/65‑1 (MQ=255) aTAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGctc  <  1:1221206/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATAGGCGGTATGCTGGCGCTGCGTGGCGAAGGGACGCCGTTTCCGGTACAGGCTGATTTCCGCTC  >  W3110S.gb/3962772‑3962836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑