Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3979476	3979484	9	31 [0]	[0] 33	mdtF	multidrug transporter, RpoS‑dependent

ACCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGT  >  W3110S.gb/3979485‑3979549 |                                                                 aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGCCGCTACATAGTCCGCGATATCg   >  1:973264/1‑64 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACg                       >  1:640983/1‑44 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATCGTcc            >  1:997848/1‑55 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGata      >  1:1860120/1‑61 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGa        >  1:1550646/1‑59 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATc    >  1:1490123/1‑63 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCg   >  1:1881186/1‑64 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCg   >  1:362807/1‑64 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCg   >  1:1677040/1‑64 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1439333/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:113690/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1256241/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:932468/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:847320/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:823281/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:783955/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:718017/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:643097/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1258387/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:60753/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1277505/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:325747/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:27672/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:274949/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:258794/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1131376/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1321553/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1679937/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1382500/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1674255/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1586758/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:1443601/1‑65 (MQ=255) aCCAACGCCCGCGGTACGGATTAGCGGGTCTTTGATATTAGCCGCTACATAGTCCGCGATATCGt  >  1:338892/1‑65 (MQ=255) |                                                                 ACCAACGCCCGCGGTACGGCTTAGCGGGTCTTTGATATTAGACGCTACATAGTCCGCGATATCGT  >  W3110S.gb/3979485‑3979549

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑