Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3994350	3994370	21	21 [0]	[0] 74	yhiR	predicted DNA (exogenous) processing protein

TGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACGCAG  >  W3110S.gb/3994371‑3994435 |                                                                 tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:386329/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:666401/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:655796/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:633496/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:52816/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:52054/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:498513/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:489763/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:421655/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:396424/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:683830/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:365983/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:354516/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:323331/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:296121/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:292560/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:210855/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:186527/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1852958/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:807921/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:987052/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:976695/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:911161/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:894603/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:88035/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:87278/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:871578/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:813542/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1850246/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:804458/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:799206/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:790076/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:758390/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:740452/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:726819/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:712237/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:709809/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1203541/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1394668/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1361998/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1359093/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1349527/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1333961/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1308310/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1262034/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1253130/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:122334/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1434426/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1195155/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1183891/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1153888/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1066476/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1063381/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1023859/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:10049/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1003004/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1585883/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1827845/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1798876/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1705134/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1694171/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:168089/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1666186/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1630922/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1597790/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1001484/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1531394/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1529646/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1523417/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1491904/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1482495/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1481522/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1464032/65‑1 (MQ=255) tGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACgcag  <  1:1437220/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TGCAGAATTTTGCGAATACCGGTCGCTTCCAGATCGTGGATCATGCGCTTAATTTGCTGACGCAG  >  W3110S.gb/3994371‑3994435

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑