Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4002612 4002674 63 100 [0] [0] 106 pitA phosphate transporter, low‑affinity

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

TCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGC  >  W3110S.gb/4002675‑4002737
|                                                              
tCATGGAATCCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1257597/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACGATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1616094/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:4050/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:592805/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:550444/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:520435/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:509342/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:490572/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:488241/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:481805/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:448127/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:446753/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:430267/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:655765/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:404712/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:371785/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:366277/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:341812/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:341040/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:323379/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:321563/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:305227/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:30244/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:238549/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:230912/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:217079/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:798024/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:983601/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:98132/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:971876/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:96001/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:941637/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:930518/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:917434/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:909814/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:897064/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:814578/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:809231/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:804174/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:605000/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:784621/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:749102/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:738001/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:712773/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:691519/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:691390/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:691319/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:690643/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:672947/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:668434/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:216404/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1202148/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1375799/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1358079/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1353675/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1353136/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1286366/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1267516/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1257236/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1244331/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1239/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1219964/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1215894/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1383309/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1195889/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1175243/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1172670/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1169149/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1130881/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:111111/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1078498/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:107529/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1068590/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1067396/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1063059/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1621471/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:200801/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:189515/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1869950/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1835828/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:182130/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1819703/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1760444/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1745714/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:172980/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1702920/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1686463/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1650319/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1018500/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1601434/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1593114/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1572795/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1525181/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1467258/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1441629/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1438165/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1405443/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1393642/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGc  <  1:1389385/63‑1 (MQ=255)
tCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAACAACAGc  <  1:797768/63‑1 (MQ=255)
|                                                              
TCATGGAAACCATTGATGGCTTCGTAGAACAGCACAAAAGCCAGTGCAAGCAATAATAACAGC  >  W3110S.gb/4002675‑4002737

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑